Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms