Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4DQ92854 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms