Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDAQ92838 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDAQ92838 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDAQ92838 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDAQ92838 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDAQ92838 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDAQ92838 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDAQ92838 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms