Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM41Q8WV44 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM41Q8WV44 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms