Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C2Q8WUA4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C2Q8WUA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms