Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms