Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms