Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71BQ8TC56 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms