Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD1Q8NHV4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms