Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
COL22A1Q8NFW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms