Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD8Q8NEN9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD8Q8NEN9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms