Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms