Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A5Q8NCS7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms