Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRYD3Q8NCJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SPRYD3Q8NCJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms