Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms