Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms