Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX3Q8N9I9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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