Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms