Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF2Q8N3S3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF2Q8N3S3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms