Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms