Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC170Q8IYT3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms