Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT1Q8IXI2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms