Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF13Q86YI8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms