Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms