Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
YTHDF3Q7Z739 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF3Q7Z739 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms