Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD1L3Q7Z443 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD1L3Q7Z443 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD1L3Q7Z443 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD1L3Q7Z443 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD1L3Q7Z443 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PKD1L3Q7Z443 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms