Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT28Q7Z3Y7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT28Q7Z3Y7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT28Q7Z3Y7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT28Q7Z3Y7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT28Q7Z3Y7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KRT28Q7Z3Y7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT28Q7Z3Y7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms