Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC80Q76M96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms