Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP34Q70CQ2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP34Q70CQ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP34Q70CQ2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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