Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms