Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPGS1Q6ZTW0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms