Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO4C1Q6ZQN7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms