Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX2Q6XYB7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX2Q6XYB7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms