Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms