Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms