Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASC4Q6P4E1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASC4Q6P4E1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms