Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms