Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL2Q6F5E8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms