Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms