Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms