Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPD7Q5XG87 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD7Q5XG87 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms