Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM78Q5T7P6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms