Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRIF1Q5T3J3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms