Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PERM1Q5SV97 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PERM1Q5SV97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms