Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC39AQ5SRH9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC39AQ5SRH9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms