Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms