Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOM1Q5C9Z4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOM1Q5C9Z4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOM1Q5C9Z4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NOM1Q5C9Z4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms