Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C4orf48Q5BLP8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms