Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC178Q5BJE1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms