Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms